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IRGSP 国際イネゲノム塩基配列解析プロジェクト

設立理念

   イネを実らせるコメは、世界の穀類生産高の約30%を占め、世界人口の約50%が日々の 食生活の中心においている重要な食料です。地球上の耕地や水資源には限りがあるにもか かわらず、依然、人口の増加は止むことがなく、2025年には80億人に達すると推測されて います。この人口増加は主にコメを主食料をしているアジア、アフリカで予測され、これ らの地域でのコメの確保が喫緊の課題となっています。しかし、数千年に及ぶイネ栽培の 歴史は、経験と慣行に頼るイネの育種をほぼ限界にまで追い込み、新たな考え方と手法の 導入なくしては人口増加に対応するだけの収穫が見込めない状況下にあります。幸いにし て、前世紀半ばに興った新たな生命科学の潮流は、あらゆる生物の遺伝情報を読みとり、 遺伝現象の分子レベルでの理解を可能にしました。イネがもつ遺伝情報を完全に理解し、これま での育種技術を世界中で共有し、食料不足を招かないようにイネのみならずコムギあるい はトウモロコシの改良に役立てなくてはなりません。この理念のもとに1997年9月国際イネ ゲノム塩基配列解析プロジェクト(IRGSP)が設立されました。
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ゲノム シーケンシング

論文リスト
Rice Functional Genomics, Challenges, Progress and Prospects.  
        Springer, Upadhyaya, Narayana M. (Ed.) [Springer] [Amazon]

Decoding the rice genome
	Vij S, Gupta V, Kumar D, Vydianathan R, Raghuvanshi S, Khurana P, Khurana JP, Tyagi AK.
		BioEssays 28.4: 421-432

A fine physical map of the rice chromosome 5
	Cheng CH, Chung MC, Liu SM, Chen SK, Kao FY, Lin SJ, Hsiao SH, Tseng IC, Hsing YI,
	Wu HP, Chen CS, Shaw JF, Wu J, Matsumoto T, Sasaki T, Chen HH, Chow TY.
		Molecular Genetics and Genomics. 274: 337-345

The sequence of rice chromosomes 11 and 12, rich in disease resistance genes 
and recent gene duplications
	The Rice Chromosomes 11 and 12 Sequencing Consortia
		BMC Biology 2005, 3:20

Sequence, annotation, and analysis of synteny between rice chromosome 3 
and diverged grass species
	The Rice Chromosome 3 Sequencing Consortium
		Genome Research 15:1284-1291, 2005

The map-based sequence of the rice genome
	International Rice Genome Sequencing Project.
		Nature 436: 793-800

In-Depth View of Structure, Activity, and Evolution of Rice Chromosome 10
	The Rice Chromosome 10 Sequencing Consortium
		Science 300:1566-1569

The genome sequence and structure of rice chromosome 1
	Sasaki T, Matsumoto T, Yamamoto K, Sakata K, Baba T, Katayose Y, Wu J, Niimura Y, 
	Cheng Z, Nagamura Y, Antonio BA, Kanamori H, Hosokawa S, Masukawa M, Arikawa K, 
	Chiden Y, Hayashi M, Okamoto M, Ando T, Aoki H, Arita K, Hamada M, Harada C, 
	Hijishita S, Honda M, Ichikawa Y, Idonuma A, Iijima M, Ikeda M, Ikeno M, Ito S, Ito T, 
	Ito Y, Ito Y, Iwabuchi A, Kamiya K, Karasawa W, Katagiri S, Kikuta A, Kobayashi N, 
	Kono I, Machita K, Maehara T, Mizuno H, Mizubayashi T, Mukai Y, Nagasaki H, 
	Nakashima M, Nakama Y, Nakamichi Y, Nakamura M, Namiki N, Negishi M, Ohta I, Ono N, 
	Saji S, Sakai K, Shibata M, Shimokawa T, Shomura A, Song J, Takazaki Y, Terasawa K, 
	Tsuji K, Waki K, Yamagata H, Yamane H, Yoshiki S, Yoshihara R, Yukawa K, Zhong H, 
	Iwama H, Endo T, Ito H, Hahn JH, Kim HI, Eun MY, Yano M, Jiang J, Gojobori T.
		Nature 420:312-316

Sequence and analysis of rice chromosome 4
	Feng Q, Zhang Y, Hao P, Wang S, Fu G, Huang Y, Li Y, Zhu J, Liu Y, Hu X, Jia P, Zhang Y, 
	Zhao Q, Ying K, Yu S, Tang Y, Weng Q, Zhang L, Lu Y, Mu J, Lu Y, Zhang LS, Yu Z, Fan D, 
	Liu X, Lu T, Li C, Wu Y, Sun T, Lei H, Li T, Hu H, Guan J, Wu M, Zhang R, Zhou B, Chen Z, 
	Chen L, Jin Z, Wang R, Yin H, Cai Z, Ren S, Lv G, Gu W, Zhu G, Tu Y, Jia J, Zhang Y, 
	Chen J, Kang H, Chen X, Shao C, Sun Y, Hu Q, Zhang X, Zhang W, Wang L, Ding C, Sheng H, 
	Gu J, Chen S, Ni L, Zhu F, Chen W, Lan L, Lai Y, Cheng Z, Gu M, Jiang J, Li J, 
	Hong G, Xue Y, Han B.
		Nature 420:316-320


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last update 8 December 2009
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